CUT&Tag资源中心

简介

CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种研究组蛋白修饰和一些转录因子的基因组定位的方法,这些转录因子可以揭示蛋白质和DNA之间的相互作用,或者确定感兴趣蛋白质的DNA结合位点。

与MNase-Seq或ATAC-Seq方法不同,它们是以开放染色质为靶点并因此依赖于染色质可及性的,而CUT&Tag是利用基于抗体的酶栓系策略以特定组蛋白修饰或蛋白质为靶点,以揭示特定于这些位点或蛋白质的染色质结合信息。

CUT&Tag与ChIP-Seq有着相同的实验原理,但前者在实验protocol上做了一些变动,这些变动在特定情况下使实验变得更便捷。在CUT&Tag中,新鲜(非冷冻)的未固定细胞与刀豆蛋白A珠结合,抗体孵育是在细胞处于原始状态下进行的,而没有ChIP-Seq实验中固定染色质的超声处理和免疫沉淀这些步骤。使用预先装载有adapter的pA-Tn5转座酶,在其与抗体结合后,一步就能同时完成消化染色质和制备NGS文库。与ChIP-Seq 相比,CUT&Tag可以使用更少的起始样本快速生成高质量的结果,并且能够从较低的测序深度进行可靠的分析,从而节省时间和降低成本。

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