ATAC-Seq资源中心

简介

ATAC-Seq stands for Assay for Transposase-Accessible Chromatin 通常简称为ATAC-Seq。ATAC-Seq方法依赖于使用超活性转座酶Tn5构建二代测序(NGS)文库。NGS测序所需的adapter被预加载到了Tn5转座酶上,这允许染色质片段化和adapter的连接同步进行,生成的DNA文库可以通过NGS进行测序,并使用生物信息学分析具有开放或可及染色质的基因组区域。

与其它技术(如FAIRE-Seq或DNase-Seq)相比,ATAC-Seq的主要优势在于检测所需的细胞数量较少,且实验方法相对简单。

ATAC-Seq实验一般只需要大约50000个细胞作为起始材料,并且由于其相对较简单的两步法实验步骤,使得它成为了开启表观研究的常用方法。无论您是想分析样本中染色质的状态,还是比较特殊处理前后的染色质状态,ATAC-Seq都可以帮您研究全基因组染色质的变化,并可以为后续实验中应该研究哪种表观遗传修饰或转录因子以及应该使用哪种方法来研究它们提供指导。

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