ChIP-Sequencing(ChIP-Seq)服务

一站式ChIP-Seq服务

客户对我们的评价

"Active Motif花时间了解我们的问题,了解了我们的目标并讨论了所有选项和含义。 不仅仅通过ChIP-Seq实验验证了我们的数据,而且还强调了一种新的机理。 数据和服务的质量惊人地好。 优秀的科学知识,知识渊博且乐于助人的人员和优质的数据。"
David Briere, PhD
首席科学家
Mirati Therapeutics
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ChIP-Seq服务包括:

客户提供固定的细胞沉淀或冷冻组织,然后我们:

  1. 准备染色质样品并超声处理。
  2. 使用验证过的抗体进行ChIP实验。
  3. 建立ChIP-Seq测序文库。
  4. 进行二代测序。
  5. 分析并发送数据。

要了解更多信息,请电话联系我们或向我们发送表观遗传服务信息申请。 您还可以下载Active Motif的表观遗传服务介绍

 
Name Cat No. Price  
FactorPath™ ChIP-Seq 25001 Get Quote
HistonePath™ ChIP-Seq 25011 Get Quote
TranscriptionPath™ ChIP-Seq 25031 Get Quote
Input-Seq 25046 Get Quote

在ChIP-Seq中,得到数据只是成功的一半。 测序完成后,必须将数千万个短序列标签比对到基因组,然后进行peak calling 。peak calling非常复杂,根据所使用的抗体,需要不同的算法来进行准确的peak calling。 然后必须将成千上万的结合位点输出到有意义的结果中,将数据与基因相关联,并允许多个样本相互比较。 聚类,热图和全基因组定位模式的可视化呈现仍面临挑战。 这种类型的深度生物信息学分析超出了大多数实验室的能力。 因此,数据分析是我们所有ChIP-Seq服务项目的标准服务的一部分。

A heat map showing the relative occupancy of demethylase KDM1A and Histone H3 dimethyl Lys4 (H3K4me2) at the transcription start sites of all genes bound by these factors
A graph depicting the relative occupancy of demethylase KDM1A and Histone H3 dimethyl Lys4 (H3K4me2) at the transcription start sites of all genes bound by these factors
图3:相对于基因转录起始位点(TSS)的所有基因组结合位点的汇集。

用组蛋白脱甲基酶KDM1A及其靶标之一的组蛋白H3K4me2抗体进行ChIP-Seq实验。 因为与基因注释有关,鉴定了数千个结合位点,并汇集了所有结合位点的位置。左图。使用由H3K4me2和KDM1A结合的所有基因创建了一个热图,并描述了转录起始位点(TSS)周围这些因子的结合率。上图。相同的数据使用不同方式显示KDM1A 在H3K4me2结合的两个峰之间的结合率。

以下论文引用了Active Motif表观遗传服务提供的有关ChIP-Seq服务和/或其他信息: